商標代理公司是專業的人員給您查詢該商標是否可以注冊，可以根據您的發展需要給您最合適的建議，但是窗口注冊就是您提交商標給您注冊，缺少專業性，如果商標被駁回了，專業的商標代理公司還可以幫您查詢是否可以申請復審。以及商標資料的拿取都是更安全的。